Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms