Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srp72F8VQC1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms