Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
5830473C10RikF8VQ07 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5830473C10RikF8VQ07 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms