Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ercc6F8VPZ5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
Ercc6F8VPZ5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ercc6F8VPZ5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms