Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp32F8VPZ3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp32F8VPZ3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms