Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Colca2F8VPY8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms