Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zc3h7bF8VPP8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zc3h7bF8VPP8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms