Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms