Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pagr1bF6V0H0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms