Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms