Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms