Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm340F6RGI3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm340F6RGI3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm340F6RGI3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm340F6RGI3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm340F6RGI3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm340F6RGI3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm340F6RGI3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm340F6RGI3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm340F6RGI3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm340F6RGI3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm340F6RGI3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms