Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms