Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms