Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms