Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mcmdc2E9Q956 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mcmdc2E9Q956 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Mcmdc2E9Q956 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mcmdc2E9Q956 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mcmdc2E9Q956 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mcmdc2E9Q956 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcmdc2E9Q956 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms