Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp31E9Q6Y8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms