Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UtrnE9Q6R7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms