Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FancfE9Q5Z5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FancfE9Q5Z5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FancfE9Q5Z5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FancfE9Q5Z5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FancfE9Q5Z5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FancfE9Q5Z5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FancfE9Q5Z5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FancfE9Q5Z5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FancfE9Q5Z5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FancfE9Q5Z5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FancfE9Q5Z5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FancfE9Q5Z5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms