Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
BC005561E9Q5E2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms