Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DspE9Q557 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DspE9Q557 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms