Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms