Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip11E9Q512 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms