Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17727E9Q4V7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17727E9Q4V7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17727E9Q4V7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17727E9Q4V7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17727E9Q4V7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm17727E9Q4V7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17727E9Q4V7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17727E9Q4V7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17727E9Q4V7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17727E9Q4V7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17727E9Q4V7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17727E9Q4V7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17727E9Q4V7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17727E9Q4V7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms