Protein–RNA interactions for Protein: E9Q346

Vmn1r160, Taste receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r160E9Q346 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r160E9Q346 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r160E9Q346 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r160E9Q346 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r160E9Q346 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r160E9Q346 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r160E9Q346 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r160E9Q346 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r160E9Q346 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r160E9Q346 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r160E9Q346 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r160E9Q346 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r160E9Q346 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r160E9Q346 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r160E9Q346 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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