Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5430401F13RikE9Q328 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms