Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fndc1E9Q043 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms