Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms