Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms