Protein–RNA interactions for Protein: E9PXQ7

Pcdh10, Protocadherin 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh10E9PXQ7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pcdh10E9PXQ7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcdh10E9PXQ7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms