Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms