Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Soga1E1U8D0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Soga1E1U8D0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms