Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cngb1E1AZ71 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cngb1E1AZ71 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cngb1E1AZ71 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms