Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Klhl3E0CZ16 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms