Protein–RNA interactions for Protein: D6MZJ6

Smpd5, MCG22096, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd5D6MZJ6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd5D6MZJ6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd5D6MZJ6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms