Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms