Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd1D3YXK1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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