Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc13D3YV10 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms