Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cttnbp2B9EJA2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms