Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clip3B9EHT4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms