Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Gm20547B8JJN0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Gm20547B8JJN0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Gm20547B8JJN0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20547B8JJN0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
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