Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pnldc1B2RXZ1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms