Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia1B2RXQ2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms