Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Polr3aB2RXC6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Polr3aB2RXC6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.8 ms