Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cspp1B2RX88 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms