Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700018F24RikB2RW27 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms