Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Abcc8B2RUS7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Abcc8B2RUS7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.86
Abcc8B2RUS7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms