Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Otud7bB2RUR8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud7bB2RUR8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms