Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms