Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms